Un déséquilibre de la microflore intestinale, appelé dysmicrobisme, peut compromettre la santé et les performances du cheval. Les facteurs entraînant des déséquilibres sont nombreux (changements brutaux de régime, stress, sevrage, manque de lest, excès de d'amidon,… ). Ils ont pour conséquences la prolifération de bactéries cellulolytiques, la production et l'accumulation d'acide lactique avec risque d'acidose lactique. Il est alors possible d’anticiper ses dérèglements par des apports de prébiotiques et/ou probiotiques qui vont agir directement sur les bonnes bactéries du système digestif.